1、一旦深圳的小产权房流通受到限制，土地集约利用就会受到阻碍。国家对土地的一贯主张，不仅是尽可能地提高土地的利用率，而且是有效地控制土地面积的利用。住房建设用地一般是这样的。只有规划好土地的使用面积，才能避免资源的浪费，满足人们对住房的需求。然而，目前我国土地利用率相对较低。
2、，与社会和经济的不断发展进步，建筑也在加快城市化的步伐，城市化建设需要联系城市又更为常见，并限制在深圳小产权流通，将在一定程度上阻碍了城市和农村之间的联系这是非常不利于城市化的发展，单方面从农村涌入城市只会造成城市人口和住房的压力，反而会加大城市与农村之间的矛盾。
3、单方面的限制深圳小产权房的流转只会造成深圳房价的进一步提高，因为有所限制，人们只有选择去购买商品房，而这其中就存在不少问题，许多人无力承担高额的房价导致无法解决住房问题，即使买得起房子也会看着房地产市场的价格不断上升，房价越高人们住房越难，这对于未来的住房问题来说很难处理。
虽然国家本身的出发点和目的都在朝着好的方向发展，但是由于深圳小产权房的特殊性，它仍然无法得到一个完美的解决方案，所以有效的处理小产权房问题还是需要考虑的。
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